Stopa smrtnosti od infekcije – IFR – karika koja nedostaje za upravljanje zaraznom bolesti COVID-19

1
1175

Objavljeno: 5.travnja 2020. godine

Autor: Rich Condit

Rich Condit je infektolog, umirovljeni profesor sa Sveučilišta Florida u Gainesvilleu i voditelj emisije “Ovaj tjedan u infektologijii”.

Institut za zdravstvenu metriku i evaluaciju (IHME) sa Sveučilišta u Washingtonu izradio je model kojim se predviđa da će se, ako se održe stroge mjere socijalnog distanciranja, „prvi val“ COVID-19 u SAD-u smiriti do sredine lipnja, s ukupnim brojem smrtnih slučajeva od oko 93.000. IHME navodi sljedeće: “Do kraja prvog vala epidemije, oko 97% stanovništva Sjedinjenih američkih država i dalje će biti podložno infekciji, a da bi se izbjegao drugi val, nužne su mjere masovnog probira, praćenja kontakata i mjere karantene.

Uznemirujuće je predviđanje koje kaže da će nakon napornog „prvog vala“ bolesti samo 3% stanovništva biti zaraženo i tako biti (barem relativno) imuno na ponovnu infekciju. Ozbiljno sumnjam da će nakon prvog vala virus „nestati“, prije bi se reklo da će biti samo dijelom pobijeđen, no s obzirom da u velikom dijelu populacije nije zastupljen, spreman je za povratak kada se ukinu društvene restrikcije. Ako do tada 97% populacije ostane nezaraženo, predstoji nam vrlo znakoviti drugi val zaraze.

No, je li postotak zaraženih od 3% točan? Ako nije, koji je stvarni broj? Da bismo to mogli razumjeti, moramo najprije shvatiti razliku između stope smrtnosti slučaja (CFR – Case Fatality Rate) i stope smrtnosti od infekcije (IFR – infection fatality rate).

  • CFR je omjer broja smrtnih slučajeva podijeljen s brojem potvrđenih slučajeva bolesti – po mogućnosti kroz testiranja nukleinske kiseline PCR; (op.p. prikazivala se stopa smrtnosti 2,4% COVID-19)
  • IFR je omjer broja umrlih podijeljen s brojem stvarnih infekcija SARS-CoV-2. (op.p. prikazivala se stopa smrtnosti 0,1% od Sezonske Gripe)

S obzirom na to da je testiranje nukleinske kiseline ograničeno i trenutno je dostupno prvenstveno osobama sa značajnim indikacijama i faktorima rizika za bolest COVID-19 te iz razloga što veliki broj infekcija SARS-CoV-2 rezultira blagom bolesti ili su one prisutne bez simptoma, IFR je izvjesno značajno niži od CFR-a. Centar za medicinu temeljenu na dokazima (CEBM) Sveučilišta u Oxfordu trenutno CFR globalno procjenjuje na 0,51%, uz sva navedena upozorenja. CEBM procjenjuje IFR na 0,1% do 0,26%, uz još veća upozorenja.

Smanjenje nekih brojeva, ako IHME procjenjuje da je nakon prvog vala 3% američke populacije (~ 330 milijuna) otporno na bolest, podrazumijeva 9,9 milijuna zaraženih. Predviđanje IHME-a da oko 93.000 smrti podrazumijeva vrijednost IFR od 0,9%, što je blizu uobičajenih globalnih procjena vrijednosti za CFR od 1%. Imajmo na umu da IHME zaista projicira broj smrtnih slučajeva na temelju stvarnih podataka, stoga ne treba kriviti odabir starijeg modela procjene stope infekcije (~ 1%), posebno s obzirom na to da je IFR u ovom trenutku osobito „sklizak„ broj. Međutim, napomenimo, argumenta radi da, ako je vrijednost IFR stvarno tako niska i iznosi 0,1%, proizlazi da će nakon prvog vala bolesti čak 30% američke populacije biti zaraženo i samim time otporno na ponovnu infekciju. Čini mi se da bi to za daljnje širenje virusa bilo znatno manje pogodno te bi značajno prigušilo utjecaj drugog vala.

Ovo nije samo intelektualna vježba. Razumijevanje stvarne stope smrtnosti od infekcije posljedično uvelike utječe na planiranje izvanrednih mjera kontrole nakon našeg prvog iskustva sa SARS-CoV-2.

Dužni smo pribaviti točne vrijednosti IFR za SARS-CoV-2 kako bismo pomogli u planiranju budućnosti pandemije. Imamo dostupne jednostavne i relativno jeftine setove za testiranje na protutijela na SARS-CoV-2 iz kapi krvi u samo nekoliko minuta. Kod ovih se testova prilagođava postojeća tehnologija razvijena za druge patogene za SARS-CoV-2. Testovi omogućuju “point-of-care” testiranje, tj. mogu se koristiti bilo gdje, rezultati se dobivaju u stvarnom vremenu, uz minimalne upute za uporabu (primjerice, FDA je dao Odobrenje za hitnu upotrebu kompaniji Cellex, Inc. za upotrebu svog seta za testiranje, a deseci drugih tvrtki i laboratorija razvijaju slične testove.) Setovi ispituju IgM i IgG antitijela specifična za SARS-CoV-2 u krvi. IgM je prvo antitijelo koje se pojavljuje nakon infekcije, obično u roku od otprilike jednog do dva tjedna. Prema tome, testom je moguće utvrditi je li ispitanik ikada bio zaražen coronavirusom SARS-CoV-2, i ako jest, je li ta infekcija bila prisutna nedavno.

Da sam ja kralj, besplatno bih podijelio SARS-CoV-2 setove testova ljekarnama širom zemlje i razmotrio mogućnost postavljanja lokacija za testiranje na uobičajeno posjećenim mjestima kao što su škole, sportski događaji, biračka mjesta te čak i barovi. Također bih uspostavio centraliziranu internetsku bazu podataka za prikupljanje i uspoređivanje rezultata testiranja. Prikupljeni podaci mogli bi se koristiti za točan izračun vrijednosti IFR-a u SAD-u, zajedno s geografskom rasprostranjenošću i eventualno drugim demografskim podacima. Spavali smo na startu za prvi val. Probudimo se i uhvatimo drugi val.

http://covid19.healthdata.org/

https://www.cebm.net/covid-19/global-covid-19-case-fatality-rates/

https://www.newscientist.com/article/2239497-why-we-still-dont-know-what-the-death-rate-is-for-covid-19/

Prijevod članka:

https://www.virology.ws/2020/04/05/infection-fatality-rate-a-critical-missing-piece-for-managing-covid-19/

0 0 votes
Article Rating
Subscribe
Notify of
1 Comment
Oldest
Newest Most Voted
Inline Feedbacks
View all comments